是一種高辛烷值汽油添加劑，化學含氧量較甲醇低得多，利于暖車和節約燃料，蒸發潛熱低，對冷啟動有利，常用于無鉛汽油和低鉛油的調合。也可以重新裂解為異丁烯，作為橡膠及其它化工產品的原料。質量*的甲基叔丁基醚，可以用作醫藥，是醫藥中間體。俗稱“醫藥級MTBE”或“醫藥級甲基叔丁基醚”。甲基叔丁基醚的毒性，危險性，在儲存和使用過程中也要充分重視。